MNE-CPP 0.1.9
A Framework for Electrophysiology
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mne_bem_surface.h
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1//=============================================================================================================
37#ifndef MNE_BEM_SURFACE_H
38#define MNE_BEM_SURFACE_H
39
40//=============================================================================================================
41// INCLUDES
42//=============================================================================================================
43
44#include "mne_global.h"
45
46#include <fiff/fiff_types.h>
47#include <fiff/fiff.h>
48
49//=============================================================================================================
50// EIGEN INCLUDES
51//=============================================================================================================
52
53#include <Eigen/Core>
54#include <Eigen/SparseCore>
55
56//=============================================================================================================
57// QT INCLUDES
58//=============================================================================================================
59
60#include <QList>
61
62//=============================================================================================================
63// DEFINE NAMESPACE MNELIB
64//=============================================================================================================
65
66namespace MNELIB
67{
68
69//=============================================================================================================
70// FORWARD DECLARATIONS
71//=============================================================================================================
72
73//=============================================================================================================
80{
81public:
82 typedef QSharedPointer<MNEBemSurface> SPtr;
83 typedef QSharedPointer<const MNEBemSurface> ConstSPtr;
85 //=========================================================================================================
90
91 //=========================================================================================================
97 MNEBemSurface(const MNEBemSurface& p_MNEBemSurface);
98
99 //=========================================================================================================
104
105 //=========================================================================================================
109 void clear();
110
111 //=========================================================================================================
119 bool addTriangleData();
120
121 //=========================================================================================================
127 bool add_geometry_info();
128
129 //=========================================================================================================
137 bool addVertexNormals();
138
139 //=========================================================================================================
145 void writeToStream(FIFFLIB::FiffStream* p_pStream);
146
147 //=========================================================================================================
155 static QString id_name(int id);
156
157public:
158 FIFFLIB::fiff_int_t id;
159 FIFFLIB::fiff_int_t np;
160 FIFFLIB::fiff_int_t ntri;
161 FIFFLIB::fiff_int_t coord_frame;
162 FIFFLIB::fiff_float_t sigma;
163 Eigen::MatrixX3f rr;
164 Eigen::MatrixX3f nn;
165 Eigen::MatrixX3i tris;
166 Eigen::MatrixX3d tri_cent;
167 Eigen::MatrixX3d tri_nn;
168 Eigen::VectorXd tri_area;
169 QVector<QVector<int> > neighbor_tri;
170 QVector<QVector<int> > neighbor_vert;
171};
172
173//=============================================================================================================
174// INLINE DEFINITIONS
175//=============================================================================================================
176} // NAMESPACE
177
178#endif // MNE_BEMSURFACE_H
FIFF class declaration, which provides static wrapper functions to stay consistent with mne matlab to...
Definitions for describing the objects in a FIFF file.
mne library export/import macros.
#define MNESHARED_EXPORT
Definition mne_global.h:56
FIFF File I/O routines.
BEM surface provides geometry information.
QVector< QVector< int > > neighbor_vert
FIFFLIB::fiff_int_t np
QSharedPointer< const MNEBemSurface > ConstSPtr
Eigen::VectorXd tri_area
FIFFLIB::fiff_float_t sigma
FIFFLIB::fiff_int_t ntri
QSharedPointer< MNEBemSurface > SPtr
QVector< QVector< int > > neighbor_tri
Eigen::MatrixX3d tri_nn
Eigen::MatrixX3i tris
FIFFLIB::fiff_int_t id
Eigen::MatrixX3d tri_cent
FIFFLIB::fiff_int_t coord_frame