fs_surfaceset.cpp

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// INCLUDES
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#include "fs_surfaceset.h"
 
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// QT INCLUDES
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#include <QStringList>
 
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// USED NAMESPACES
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using namespace FSLIB;
using namespace Eigen;
 
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// DEFINE MEMBER METHODS
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FsSurfaceSet::FsSurfaceSet()
{
}
 
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FsSurfaceSet::FsSurfaceSet(const QString& subject_id, qint32 hemi, const QString& surf, const QString& subjects_dir)
{
    FsSurface t_Surface;
    if (hemi == 0 || hemi == 1) {
        if (FsSurface::read(subject_id, hemi, surf, subjects_dir, t_Surface))
            insert(t_Surface);
    } else if (hemi == 2) {
        if (FsSurface::read(subject_id, 0, surf, subjects_dir, t_Surface))
            insert(t_Surface);
        if (FsSurface::read(subject_id, 1, surf, subjects_dir, t_Surface))
            insert(t_Surface);
    }
 
    calcOffset();
}
 
//=============================================================================================================
 
FsSurfaceSet::FsSurfaceSet(const QString& path, qint32 hemi, const QString& surf)
{
    FsSurface t_Surface;
    if (hemi == 0 || hemi == 1) {
        if (FsSurface::read(path, hemi, surf, t_Surface))
            insert(t_Surface);
    } else if (hemi == 2) {
        if (FsSurface::read(path, 0, surf, t_Surface))
            insert(t_Surface);
        if (FsSurface::read(path, 1, surf, t_Surface))
            insert(t_Surface);
    }
 
    calcOffset();
}
 
//=============================================================================================================
 
FsSurfaceSet::FsSurfaceSet(const FsSurface& p_LHSurface, const FsSurface& p_RHSurface)
{
    if (p_LHSurface.hemi() == 0)
        m_qMapSurfs.insert(0, p_LHSurface);
    else
        qWarning("Left hemisphere id is not 0. LH surface not assigned!");
 
    if (p_RHSurface.hemi() == 1)
        m_qMapSurfs.insert(1, p_RHSurface);
    else
        qWarning("Right hemisphere id is not 1. RH surface not assigned!");
 
    calcOffset();
}
 
//=============================================================================================================
 
FsSurfaceSet::FsSurfaceSet(const QString& p_sLHFileName, const QString& p_sRHFileName)
{
    FsSurfaceSet t_SurfaceSet;
    if (FsSurfaceSet::read(p_sLHFileName, p_sRHFileName, t_SurfaceSet))
        *this = t_SurfaceSet;
}
 
//=============================================================================================================
 
FsSurfaceSet::~FsSurfaceSet()
{
}
 
//=============================================================================================================
 
void FsSurfaceSet::clear()
{
    m_qMapSurfs.clear();
}
 
//=============================================================================================================
 
void FsSurfaceSet::insert(const FsSurface& p_Surface)
{
    if (p_Surface.isEmpty())
        return;
 
    qint32 hemi = p_Surface.hemi();
    m_qMapSurfs.remove(hemi);
 
    m_qMapSurfs.insert(hemi, p_Surface);
}
 
//=============================================================================================================
 
bool FsSurfaceSet::read(const QString& p_sLHFileName, const QString& p_sRHFileName, FsSurfaceSet& p_SurfaceSet)
{
    p_SurfaceSet.clear();
 
    QStringList t_qListFileName;
    t_qListFileName << p_sLHFileName << p_sRHFileName;
 
    for (qint32 i = 0; i < t_qListFileName.size(); ++i) {
        FsSurface t_Surface;
        if (FsSurface::read(t_qListFileName[i], t_Surface)) {
            if (t_qListFileName[i].contains("lh."))
                p_SurfaceSet.m_qMapSurfs.insert(0, t_Surface);
            else if (t_qListFileName[i].contains("rh."))
                p_SurfaceSet.m_qMapSurfs.insert(1, t_Surface);
            else
                return false;
        }
    }
 
    if (p_SurfaceSet.m_qMapSurfs.isEmpty())
        return false;
 
    p_SurfaceSet.calcOffset();
 
    return true;
}
 
//=============================================================================================================
 
namespace
{
 
qint32 hemiIndex(qint32 idx)
{
    if (idx != 0 && idx != 1) {
        qWarning("Warning: Index is not '0' or '1'! Returning '0'.");
        return 0;
    }
    return idx;
}
 
qint32 hemiIndex(const QString& idt)
{
    if (idt == QLatin1String("rh"))
        return 1;
    if (idt != QLatin1String("lh"))
        qWarning("Warning: Identifier is not 'lh' or 'rh'! Returning 'lh'.");
    return 0;
}
 
const FsSurface& surfaceOrEmpty(const QMap<qint32, FsSurface>& surfs, qint32 hemi)
{
    static const FsSurface empty;
    const auto it = surfs.constFind(hemi);
    return it != surfs.constEnd() ? it.value() : empty;
}
 
} // namespace
 
//=============================================================================================================
 
const FsSurface& FsSurfaceSet::operator[](qint32 idx) const
{
    return surfaceOrEmpty(m_qMapSurfs, hemiIndex(idx));
}
 
//=============================================================================================================
 
FsSurface& FsSurfaceSet::operator[](qint32 idx)
{
    return m_qMapSurfs[hemiIndex(idx)];
}
 
//=============================================================================================================
 
const FsSurface& FsSurfaceSet::operator[](QString idt) const
{
    return surfaceOrEmpty(m_qMapSurfs, hemiIndex(idt));
}
 
//=============================================================================================================
 
FsSurface& FsSurfaceSet::operator[](QString idt)
{
    return m_qMapSurfs[hemiIndex(idt)];
}
 
//=============================================================================================================
 
void FsSurfaceSet::calcOffset()
{
    //
    // Correct inflated offset
    //
    if (m_qMapSurfs.size() == 2 && QString::compare(m_qMapSurfs.begin().value().surf(), "inflated") == 0) {
        float xOffset = m_qMapSurfs.find(0).value().rr().col(0).maxCoeff() - m_qMapSurfs.find(1).value().rr().col(0).minCoeff();
        Vector3f vecLhOffset, vecRhOffset;
        vecLhOffset << (xOffset / 2.0f), 0, 0;
        vecRhOffset << (-xOffset / 2.0f), 0, 0;
        m_qMapSurfs.find(0).value().offset() = vecLhOffset;
        m_qMapSurfs.find(1).value().offset() = vecRhOffset;
    }
}