mne_raw_data.h

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#ifndef MNERAWDATA_H
#define MNERAWDATA_H
 
//=============================================================================================================
// INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include "mne_global.h"
 
#include <fiff/fiff_dir_node.h>
#include <fiff/fiff_stream.h>
#include "mne_raw_info.h"
#include "mne_raw_buf_def.h"
#include "mne_proj_op.h"
#include "mne_sss_data.h"
#include "mne_ctf_comp_data_set.h"
#include "mne_deriv.h"
#include "mne_deriv_set.h"
#include "mne_types.h"
 
//=============================================================================================================
// STL INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <memory>
#include <vector>
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <QSharedPointer>
#include <QList>
#include <QFile>
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE MNELIB
//=============================================================================================================
 
namespace MNELIB
{
 
//=============================================================================================================
// FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
struct RingBuffer;
struct FilterData;
 
//=============================================================================================================
class MNESHARED_EXPORT MNERawData
{
public:
    typedef QSharedPointer<MNERawData> SPtr;            
    typedef QSharedPointer<const MNERawData> ConstSPtr; 
 
    //=========================================================================================================
    MNERawData();
 
    //=========================================================================================================
    ~MNERawData();

    void add_filter_response(int* highpass_effective);

    void setup_filter_bufs();

    bool setFilter(const MNEFilterDef& newFilter);

    int load_one_buffer(MNERawBufDef* buf);

    int compensate_buffer(MNERawBufDef* buf);

    int pick_data(mneChSelection sel,
                  int firsts,
                  int ns,
                  float** picked);

    int pick_data_proj(mneChSelection sel,
                       int firsts,
                       int ns,
                       float** picked);

    int load_one_filt_buf(MNERawBufDef* buf);

    int pick_data_filt(mneChSelection sel,
                       int firsts,
                       int ns,
                       float** picked);

    static MNERawData* open_file_comp(const QString& name, int omit_skip, int allow_maxshield, const MNEFilterDef& filter, int comp_set);

    static MNERawData* open_file(const QString& name, int omit_skip, int allow_maxshield, const MNEFilterDef& filter);
 
    //=========================================================================================================
    int attachDerivations(const MNEDerivSet& derivations, bool keepPrevious = false);
 
public:
    QString filename; 
    //  FIFFLIB::fiffFile       file;
    std::unique_ptr<QFile> file;                     
    FIFFLIB::FiffStream::SPtr stream;                
    std::unique_ptr<MNELIB::MNERawInfo> info;        
    QStringList ch_names;                            
    QStringList badlist;                             
    int nbad;                                        
    Eigen::VectorXi bad;                             
    std::vector<MNELIB::MNERawBufDef> bufs;          
    std::vector<MNELIB::MNERawBufDef> filt_bufs;     
    int first_samp;                                  
    int omit_samp;                                   
    int first_samp_old;                              
    int omit_samp_old;                               
    int nsamp;                                       
    Eigen::VectorXf first_sample_val;                
    std::unique_ptr<MNELIB::MNEProjOp> proj;         
    std::unique_ptr<MNELIB::MNESssData> sss;         
    std::unique_ptr<MNELIB::MNECTFCompDataSet> comp; 
    int comp_file;                                   
    int comp_now;                                    
    std::unique_ptr<MNEFilterDef> filter;            
    std::unique_ptr<FilterData> filter_data;         
    std::unique_ptr<MNEEventList> event_list;        
    unsigned int max_event;                          
    QString dig_trigger;                             
    unsigned int dig_trigger_mask;                   
    Eigen::VectorXf offsets;                         
    std::unique_ptr<RingBuffer> ring;                
    std::unique_ptr<RingBuffer> filt_ring;           
    std::unique_ptr<MNELIB::MNEDerivSet> deriv;      
    std::unique_ptr<MNELIB::MNEDeriv> deriv_matched; 
};
 
//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
} // NAMESPACE MNELIB
 
#endif // MNERAWDATA_H