python_test_helper.cpp

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// INCLUDES
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#include "python_test_helper.h"
 
#include <QCoreApplication>
#include <QDir>
#include <QFile>
#include <QProcessEnvironment>
#include <QTextStream>
#include <QRegularExpression>
 
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// USED NAMESPACES
//=============================================================================================================
 
using namespace UTILSLIB;
using namespace Eigen;
 
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// DEFINE MEMBER METHODS
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PythonTestHelper::PythonTestHelper()
{
}
 
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bool PythonTestHelper::isAvailable() const
{
    return isPythonAvailable() && hasPackage("mne");
}
 
//=============================================================================================================
 
bool PythonTestHelper::isPythonAvailable() const
{
    return m_runner.isPythonAvailable();
}
 
//=============================================================================================================
 
bool PythonTestHelper::hasPackage(const QString& packageName) const
{
    return m_runner.isPackageAvailable(packageName);
}
 
//=============================================================================================================
 
PythonRunnerResult PythonTestHelper::eval(const QString& code, int timeoutMs) const
{
    Q_UNUSED(timeoutMs);
    return m_runner.runCode(code);
}
 
//=============================================================================================================
 
double PythonTestHelper::evalDouble(const QString& code, bool* ok, int timeoutMs) const
{
    PythonRunnerResult result = eval(code, timeoutMs);
    if (!result.success) {
        if (ok)
            *ok = false;
        return 0.0;
    }
 
    bool parseOk = false;
    double value = result.stdOut.trimmed().toDouble(&parseOk);
    if (ok)
        *ok = parseOk;
    return parseOk ? value : 0.0;
}
 
//=============================================================================================================
 
VectorXd PythonTestHelper::evalVector(const QString& code, bool* ok, int timeoutMs) const
{
    PythonRunnerResult result = eval(code, timeoutMs);
    if (!result.success) {
        if (ok)
            *ok = false;
        return VectorXd();
    }
 
    // Parse stdout: one value per line, or space-separated on one line
    QString output = result.stdOut.trimmed();
    if (output.isEmpty()) {
        if (ok)
            *ok = false;
        return VectorXd();
    }
 
    QStringList lines = output.split('\n', Qt::SkipEmptyParts);
 
    // If single line, split by whitespace
    QList<double> values;
    for (const QString& line : lines) {
        QStringList tokens = line.trimmed().split(QRegularExpression("\\s+"), Qt::SkipEmptyParts);
        for (const QString& token : tokens) {
            bool parseOk = false;
            double val = token.toDouble(&parseOk);
            if (!parseOk) {
                if (ok)
                    *ok = false;
                return VectorXd();
            }
            values.append(val);
        }
    }
 
    VectorXd vec(values.size());
    for (int i = 0; i < values.size(); ++i) {
        vec(i) = values[i];
    }
 
    if (ok)
        *ok = true;
    return vec;
}
 
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MatrixXd PythonTestHelper::evalMatrix(const QString& code, bool* ok, int timeoutMs) const
{
    PythonRunnerResult result = eval(code, timeoutMs);
    if (!result.success) {
        if (ok)
            *ok = false;
        return MatrixXd();
    }
 
    QString output = result.stdOut.trimmed();
    if (output.isEmpty()) {
        if (ok)
            *ok = false;
        return MatrixXd();
    }
 
    QStringList lines = output.split('\n', Qt::SkipEmptyParts);
    int nRows = lines.size();
    int nCols = -1;
 
    QList<QList<double>> rowData;
    for (const QString& line : lines) {
        QStringList tokens = line.trimmed().split(QRegularExpression("\\s+"), Qt::SkipEmptyParts);
        if (nCols < 0) {
            nCols = tokens.size();
        } else if (tokens.size() != nCols) {
            if (ok)
                *ok = false;
            return MatrixXd();
        }
 
        QList<double> row;
        for (const QString& token : tokens) {
            bool parseOk = false;
            double val = token.toDouble(&parseOk);
            if (!parseOk) {
                if (ok)
                    *ok = false;
                return MatrixXd();
            }
            row.append(val);
        }
        rowData.append(row);
    }
 
    if (nCols <= 0) {
        if (ok)
            *ok = false;
        return MatrixXd();
    }
 
    MatrixXd mat(nRows, nCols);
    for (int r = 0; r < nRows; ++r) {
        for (int c = 0; c < nCols; ++c) {
            mat(r, c) = rowData[r][c];
        }
    }
 
    if (ok)
        *ok = true;
    return mat;
}
 
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PythonRunnerResult PythonTestHelper::runScript(const QString& scriptPath,
                                               const QStringList& args,
                                               int timeoutMs) const
{
    Q_UNUSED(timeoutMs);
    return m_runner.run(scriptPath, args);
}
 
//=============================================================================================================
 
QString PythonTestHelper::testDataPath()
{
    return QCoreApplication::applicationDirPath() + "/../resources/data/mne-cpp-test-data/";
}
 
//=============================================================================================================
 
bool PythonTestHelper::isPythonRequired()
{
    const QString val = QProcessEnvironment::systemEnvironment().value("MNE_REQUIRE_PYTHON").toLower();
    return val == "true" || val == "1";
}
 
//=============================================================================================================
 
bool PythonTestHelper::writeMatrix(const QString& filePath, const MatrixXd& mat)
{
    QFile file(filePath);
    if (!file.open(QIODevice::WriteOnly | QIODevice::Text)) {
        return false;
    }
 
    QTextStream out(&file);
    out.setRealNumberNotation(QTextStream::ScientificNotation);
    out.setRealNumberPrecision(17);
 
    for (int r = 0; r < mat.rows(); ++r) {
        for (int c = 0; c < mat.cols(); ++c) {
            if (c > 0)
                out << ' ';
            out << mat(r, c);
        }
        out << '\n';
    }
 
    file.close();
    return true;
}
 
//=============================================================================================================
 
MatrixXd PythonTestHelper::readMatrix(const QString& filePath, bool* ok)
{
    QFile file(filePath);
    if (!file.open(QIODevice::ReadOnly | QIODevice::Text)) {
        if (ok)
            *ok = false;
        return MatrixXd();
    }
 
    QTextStream in(&file);
    QList<QList<double>> rowData;
    int nCols = -1;
 
    while (!in.atEnd()) {
        QString line = in.readLine().trimmed();
        if (line.isEmpty())
            continue;
 
        QStringList tokens = line.split(QRegularExpression("\\s+"), Qt::SkipEmptyParts);
        if (nCols < 0) {
            nCols = tokens.size();
        } else if (tokens.size() != nCols) {
            if (ok)
                *ok = false;
            return MatrixXd();
        }
 
        QList<double> row;
        for (const QString& token : tokens) {
            bool parseOk = false;
            double val = token.toDouble(&parseOk);
            if (!parseOk) {
                if (ok)
                    *ok = false;
                return MatrixXd();
            }
            row.append(val);
        }
        rowData.append(row);
    }
 
    file.close();
 
    if (rowData.isEmpty() || nCols <= 0) {
        if (ok)
            *ok = false;
        return MatrixXd();
    }
 
    MatrixXd mat(rowData.size(), nCols);
    for (int r = 0; r < rowData.size(); ++r) {
        for (int c = 0; c < nCols; ++c) {
            mat(r, c) = rowData[r][c];
        }
    }
 
    if (ok)
        *ok = true;
    return mat;
}
 
//=============================================================================================================
 
MatrixXd PythonTestHelper::evalMatrixViaFile(const QString& code,
                                             const QString& outputFilePath,
                                             bool* ok,
                                             int timeoutMs) const
{
    PythonRunnerResult result = eval(code, timeoutMs);
    if (!result.success) {
        if (ok)
            *ok = false;
        return MatrixXd();
    }
 
    return readMatrix(outputFilePath, ok);
}