inv_dics.h

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#ifndef INV_DICS_H
#define INV_DICS_H
 
//=============================================================================================================
// INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include "../inv_global.h"
#include "../inv_source_estimate.h"
#include "inv_beamformer.h"
#include "inv_beamformer_settings.h"
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
 
#include <fiff/fiff_cov.h>
 
#include <QList>
 
//=============================================================================================================
// STL INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <vector>
 
//=============================================================================================================
// FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
namespace MNELIB
{
class MNEForwardSolution;
}
namespace FIFFLIB
{
class FiffInfo;
}
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE INVLIB
//=============================================================================================================
 
namespace INVLIB
{
 
//=============================================================================================================
class INVSHARED_EXPORT InvDICS
{
public:
    //=========================================================================================================
    static InvBeamformer makeDICS(const FIFFLIB::FiffInfo& info,
                                  const MNELIB::MNEForwardSolution& forward,
                                  const std::vector<Eigen::MatrixXd>& csdMatrices,
                                  const Eigen::VectorXd& frequencies,
                                  double reg = 0.05,
                                  bool realFilter = true,
                                  const FIFFLIB::FiffCov& noiseCov = FIFFLIB::FiffCov(),
                                  BeamformerPickOri pickOri = BeamformerPickOri::None,
                                  BeamformerWeightNorm weightNorm = BeamformerWeightNorm::UnitNoiseGain,
                                  bool reduceRank = false,
                                  BeamformerInversion invMethod = BeamformerInversion::Matrix);
 
    //=========================================================================================================
    static InvSourceEstimate applyDICSCsd(const std::vector<Eigen::MatrixXd>& csdMatrices,
                                          const Eigen::VectorXd& frequencies,
                                          const InvBeamformer& filters);
 
    //=========================================================================================================
    static InvSourceEstimate applyDICS(const Eigen::MatrixXd& data,
                                       float tmin,
                                       float tstep,
                                       const InvBeamformer& filters,
                                       int freqIdx = 0);
 
    //=========================================================================================================
    static QList<InvSourceEstimate> applyDICSEpochs(const QList<Eigen::MatrixXd>& epochs,
                                                    float tmin,
                                                    float tstep,
                                                    const InvBeamformer& filters,
                                                    int freqIdx = 0);
};
 
} // NAMESPACE INVLIB
 
#endif // INV_DICS_H