mne_ctf_comp_data_set.h

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#ifndef MNECTFCOMPDATASET_H
#define MNECTFCOMPDATASET_H
 
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// INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include "mne_global.h"
 
#include "mne_named_matrix.h"
#include <fiff/fiff_sparse_matrix.h>
 
//=============================================================================================================
// STL INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <memory>
#include <vector>
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
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#include <QSharedPointer>
#include <QList>
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE MNELIB
//=============================================================================================================
 
namespace MNELIB
{
 
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// FORWARD DECLARATIONS
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class MNECTFCompData;
 
//=============================================================================================================
class MNESHARED_EXPORT MNECTFCompDataSet
{
public:
    typedef QSharedPointer<MNECTFCompDataSet> SPtr;             
    typedef QSharedPointer<const MNECTFCompDataSet> ConstSPtr;  
    typedef std::unique_ptr<MNECTFCompDataSet> UPtr;            
 
    //=========================================================================================================
    MNECTFCompDataSet();
 
    //=========================================================================================================
    MNECTFCompDataSet(const MNECTFCompDataSet& set);
 
    //=========================================================================================================
    ~MNECTFCompDataSet();
 
    //=========================================================================================================
    static std::unique_ptr<MNECTFCompDataSet> read(const QString& name);
 
    //=========================================================================================================
    int make_comp(const QList<FIFFLIB::FiffChInfo>& chs,
                  int nch,
                  QList<FIFFLIB::FiffChInfo> compchs,
                  int ncomp);
 
    //=========================================================================================================
    static int set_comp(QList<FIFFLIB::FiffChInfo> &chs,
                        int        nch,
                        int        comp);
 
    //=========================================================================================================
    int apply(bool                 do_it,
              Eigen::Ref<Eigen::VectorXf>     data,
              Eigen::Ref<const Eigen::VectorXf> compdata);
 
    //=========================================================================================================
    int apply(bool                 do_it,
              Eigen::Ref<Eigen::VectorXf>     data);
 
    //=========================================================================================================
    int apply_transpose(bool              do_it,
                        Eigen::MatrixXf&  data);
 
    //=========================================================================================================
    static int get_comp(const QList<FIFFLIB::FiffChInfo>& chs,int nch);
 
    //=========================================================================================================
    static int map_comp_kind(int grad);
 
    //=========================================================================================================
    static QString explain_comp(int kind);
 
    //=========================================================================================================
    int set_compensation(int compensate_to,
                         QList<FIFFLIB::FiffChInfo>& chs,
                         int nchan,
                         QList<FIFFLIB::FiffChInfo> comp_chs,
                         int ncomp_chan);
 
public:
    std::vector<std::unique_ptr<MNECTFCompData>> comps;   
    int            ncomp;           
    QList<FIFFLIB::FiffChInfo>     chs;    
    int            nch;             
    std::unique_ptr<MNECTFCompData> undo;           
    std::unique_ptr<MNECTFCompData> current;        
};
 
//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
} // NAMESPACE MNELIB
 
#endif // MNECTFCOMPDATASET_H