mne_raw_data.h

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#ifndef MNERAWDATA_H
#define MNERAWDATA_H
 
//=============================================================================================================
// INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include "mne_global.h"
 
#include <fiff/fiff_dir_node.h>
#include <fiff/fiff_stream.h>
#include "mne_raw_info.h"
#include "mne_raw_buf_def.h"
#include "mne_proj_op.h"
#include "mne_sss_data.h"
#include "mne_ctf_comp_data_set.h"
#include "mne_deriv.h"
#include "mne_deriv_set.h"
#include "mne_types.h"
 
//=============================================================================================================
// STL INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <memory>
#include <vector>
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <QSharedPointer>
#include <QList>
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE MNELIB
//=============================================================================================================
 
namespace MNELIB
{
 
//=============================================================================================================
// FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
struct RingBuffer;
struct FilterData;
 
//=============================================================================================================
class MNESHARED_EXPORT MNERawData
{
public:
    typedef QSharedPointer<MNERawData> SPtr;              
    typedef QSharedPointer<const MNERawData> ConstSPtr;   
 
    //=========================================================================================================
    MNERawData();
 
    //=========================================================================================================
    ~MNERawData();

    void add_filter_response(int *highpass_effective);

    void setup_filter_bufs();

    int load_one_buffer(MNERawBufDef* buf);

    int compensate_buffer(MNERawBufDef* buf);

    int pick_data(mneChSelection sel,
                  int            firsts,
                  int            ns,
                  float          **picked);

    int pick_data_proj(mneChSelection sel,
                       int            firsts,
                       int            ns,
                       float          **picked);

    int load_one_filt_buf(MNERawBufDef* buf);

    int pick_data_filt(mneChSelection sel,
                       int            firsts,
                       int            ns,
                       float          **picked);

    static MNERawData* open_file_comp(const QString& name, int omit_skip, int allow_maxshield, const MNEFilterDef& filter, int comp_set);

    static MNERawData* open_file(const QString& name, int omit_skip, int allow_maxshield, const MNEFilterDef& filter);
 
public:
    QString         filename;             
    //  FIFFLIB::fiffFile       file;
    FIFFLIB::FiffStream::SPtr stream;     
    std::unique_ptr<MNELIB::MNERawInfo> info;      
    QStringList     ch_names;           
    QStringList     badlist;            
    int             nbad;               
    Eigen::VectorXi  bad;               
    std::vector<MNELIB::MNERawBufDef> bufs;  
    std::vector<MNELIB::MNERawBufDef> filt_bufs;  
    int             first_samp;         
    int             omit_samp;          
    int             first_samp_old;     
    int             omit_samp_old;      
    int             nsamp;              
    Eigen::VectorXf  first_sample_val;  
    std::unique_ptr<MNELIB::MNEProjOp> proj;            
    std::unique_ptr<MNELIB::MNESssData> sss;            
    std::unique_ptr<MNELIB::MNECTFCompDataSet> comp;    
    int             comp_file;          
    int             comp_now;           
    std::unique_ptr<MNEFilterDef> filter; 
    std::unique_ptr<FilterData> filter_data;  
    std::unique_ptr<MNEEventList> event_list; 
    unsigned int    max_event;          
    QString         dig_trigger;        
    unsigned int     dig_trigger_mask;  
    Eigen::VectorXf  offsets;           
    std::unique_ptr<RingBuffer> ring;        
    std::unique_ptr<RingBuffer> filt_ring;   
    std::unique_ptr<MNELIB::MNEDerivSet> deriv;        
    std::unique_ptr<MNELIB::MNEDeriv> deriv_matched;   
};
 
//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
} // NAMESPACE MNELIB
 
#endif // MNERAWDATA_H