inv_lcmv.h

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#ifndef INV_LCMV_H
#define INV_LCMV_H
 
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// INCLUDES
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#include "../inv_global.h"
#include "../inv_source_estimate.h"
#include "inv_beamformer.h"
#include "inv_beamformer_settings.h"
 
#include <fiff/fiff_cov.h>
 
#include <QList>
 
//=============================================================================================================
// FORWARD DECLARATIONS
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namespace MNELIB
{
class MNEForwardSolution;
}
namespace FIFFLIB
{
class FiffEvoked;
class FiffInfo;
}
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE INVLIB
//=============================================================================================================
 
namespace INVLIB
{
 
//=============================================================================================================
class INVSHARED_EXPORT InvLCMV
{
public:
    //=========================================================================================================
    static InvBeamformer makeLCMV(const FIFFLIB::FiffInfo& info,
                                  const MNELIB::MNEForwardSolution& forward,
                                  const FIFFLIB::FiffCov& dataCov,
                                  double reg = 0.05,
                                  const FIFFLIB::FiffCov& noiseCov = FIFFLIB::FiffCov(),
                                  BeamformerPickOri pickOri = BeamformerPickOri::None,
                                  BeamformerWeightNorm weightNorm = BeamformerWeightNorm::UnitNoiseGain,
                                  bool reduceRank = false,
                                  BeamformerInversion invMethod = BeamformerInversion::Matrix);
 
    //=========================================================================================================
    static InvSourceEstimate applyLCMV(const FIFFLIB::FiffEvoked& evoked,
                                       const InvBeamformer& filters);
 
    //=========================================================================================================
    static InvSourceEstimate applyLCMVRaw(const Eigen::MatrixXd& data,
                                          float tmin,
                                          float tstep,
                                          const InvBeamformer& filters);
 
    //=========================================================================================================
    static InvSourceEstimate applyLCMVCov(const FIFFLIB::FiffCov& dataCov,
                                          const InvBeamformer& filters);
 
    //=========================================================================================================
    static QList<InvSourceEstimate> applyLCMVEpochs(const QList<Eigen::MatrixXd>& epochs,
                                                    float tmin,
                                                    float tstep,
                                                    const InvBeamformer& filters);
 
    //=========================================================================================================
    static Eigen::MatrixXd makeLCMVResolutionMatrix(
        const MNELIB::MNEForwardSolution& forward,
        const FIFFLIB::FiffInfo& info,
        const FIFFLIB::FiffCov& dataCov,
        double reg = 0.05,
        const FIFFLIB::FiffCov& noiseCov = FIFFLIB::FiffCov());
 
private:
    static Eigen::MatrixXd applyFilter(const Eigen::MatrixXd& data,
                                       const InvBeamformer& filters);
};
 
} // NAMESPACE INVLIB
 
#endif // INV_LCMV_H