mne_ctf_comp_data_set.h

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#ifndef MNECTFCOMPDATASET_H
#define MNECTFCOMPDATASET_H
 
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// INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include "mne_global.h"
 
#include "mne_named_matrix.h"
#include <fiff/fiff_sparse_matrix.h>
 
//=============================================================================================================
// STL INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <memory>
#include <vector>
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
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#include <QSharedPointer>
#include <QList>
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE MNELIB
//=============================================================================================================
 
namespace MNELIB
{
 
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// FORWARD DECLARATIONS
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class MNECTFCompData;
 
//=============================================================================================================
class MNESHARED_EXPORT MNECTFCompDataSet
{
public:
    typedef QSharedPointer<MNECTFCompDataSet> SPtr;            
    typedef QSharedPointer<const MNECTFCompDataSet> ConstSPtr; 
    typedef std::unique_ptr<MNECTFCompDataSet> UPtr;           
 
    //=========================================================================================================
    MNECTFCompDataSet();
 
    //=========================================================================================================
    MNECTFCompDataSet(const MNECTFCompDataSet& set);
 
    //=========================================================================================================
    ~MNECTFCompDataSet();
 
    //=========================================================================================================
    static std::unique_ptr<MNECTFCompDataSet> read(const QString& name);
 
    //=========================================================================================================
    int make_comp(const QList<FIFFLIB::FiffChInfo>& chList,
                  int nChan,
                  QList<FIFFLIB::FiffChInfo> compchs,
                  int nCompChan);
 
    //=========================================================================================================
    static int set_comp(QList<FIFFLIB::FiffChInfo>& chs,
                        int nch,
                        int comp);
 
    //=========================================================================================================
    int apply(bool do_it,
              Eigen::Ref<Eigen::VectorXf> data,
              Eigen::Ref<const Eigen::VectorXf> compdata);
 
    //=========================================================================================================
    int apply(bool do_it,
              Eigen::Ref<Eigen::VectorXf> data);
 
    //=========================================================================================================
    int apply_transpose(bool do_it,
                        Eigen::MatrixXf& data);
 
    //=========================================================================================================
    static int get_comp(const QList<FIFFLIB::FiffChInfo>& chs, int nch);
 
    //=========================================================================================================
    static int map_comp_kind(int grad);
 
    //=========================================================================================================
    static QString explain_comp(int kind);
 
    //=========================================================================================================
    int set_compensation(int compensate_to,
                         QList<FIFFLIB::FiffChInfo>& chList,
                         int nchan,
                         QList<FIFFLIB::FiffChInfo> comp_chs,
                         int ncomp_chan);
 
public:
    std::vector<std::unique_ptr<MNECTFCompData>> comps; 
    int ncomp;                                          
    QList<FIFFLIB::FiffChInfo> chs;                     
    int nch;                                            
    std::unique_ptr<MNECTFCompData> undo;               
    std::unique_ptr<MNECTFCompData> current;            
};
 
//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
} // NAMESPACE MNELIB
 
#endif // MNECTFCOMPDATASET_H