mne_meas_data.h

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#ifndef MNE_MEAS_DATA_H
#define MNE_MEAS_DATA_H
 
//=============================================================================================================
// INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include "mne_global.h"
#include <fiff/fiff_types.h>
 
#include "mne_types.h"
#include "mne_raw_data.h"
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <QSharedPointer>
 
//=============================================================================================================
// STL INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <memory>
#include <vector>
 
//=============================================================================================================
// FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
namespace FIFFLIB
{
class FiffCoordTrans;
}
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE MNELIB
//=============================================================================================================
 
namespace MNELIB
{
 
//=============================================================================================================
// MNELIB FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
class MNEInverseOperator;
class MNEMeasDataSet;
class MNENamedMatrix;
 
//=============================================================================================================
class MNESHARED_EXPORT MNEMeasData
{
public:
    typedef QSharedPointer<MNEMeasData> SPtr;            
    typedef QSharedPointer<const MNEMeasData> ConstSPtr; 
 
    //=========================================================================================================
    MNEMeasData();
 
    //=========================================================================================================
    ~MNEMeasData();
 
    //=========================================================================================================
    void adjust_baselines(float bmin, float bmax);
 
    //============================= mne_read_data.c =============================

    static MNEMeasData* mne_read_meas_data_add(const QString& name,
                                               int set,
                                               MNEInverseOperator* op,
                                               MNENamedMatrix* fwd,
                                               const QStringList& namesp,
                                               int nnamesp,
                                               MNEMeasData* add_to);

    static MNEMeasData* mne_read_meas_data(const QString& name,
                                           int set,
                                           MNEInverseOperator* op,
                                           MNENamedMatrix* fwd,
                                           const QStringList& namesp,
                                           int nnamesp);
 
public:
    QString filename;                                    
    FIFFLIB::FiffId meas_id;                             
    FIFFLIB::FiffTime meas_date;                         
    QList<FIFFLIB::FiffChInfo> chs;                      
    std::unique_ptr<FIFFLIB::FiffCoordTrans> meg_head_t; 
    std::unique_ptr<FIFFLIB::FiffCoordTrans> mri_head_t; 
    float sfreq;                                         
    int nchan;                                           
    float highpass;                                      
    float lowpass;                                       
    std::unique_ptr<MNEProjOp> proj;                     
    std::unique_ptr<MNECTFCompDataSet> comp;             
    MNEInverseOperator* op;                              
    MNENamedMatrix* fwd;                                 
    std::unique_ptr<MNERawData> raw;                     
    mneChSelection chsel;                                
    QStringList badlist;                                 
    int nbad;                                            
    Eigen::VectorXi bad;                                 
 
    bool ch_major;               
    QList<MNEMeasDataSet*> sets; 
    int nset;                    
    MNEMeasDataSet* current;     
};
 
//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
} // NAMESPACE MNELIB
 
#endif // MNE_MEAS_DATA_H