mne_morph_map.h

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#ifndef MNEMORPHMAP_H
#define MNEMORPHMAP_H
 
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// INCLUDES
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#include "mne_global.h"
#include "fiff/fiff_sparse_matrix.h"
 
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// STL INCLUDES
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#include <memory>
#include <optional>
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
#include <Eigen/SparseCore>
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <QList>
#include <QSharedPointer>
#include <QString>
 
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// FORWARD DECLARATIONS
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//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE MNELIB
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namespace MNELIB
{
 
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// MNELIB FORWARD DECLARATIONS
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class MNESHARED_EXPORT MNEMorphMap
{
public:
    typedef QSharedPointer<MNEMorphMap> SPtr;            
    typedef QSharedPointer<const MNEMorphMap> ConstSPtr; 
 
    MNEMorphMap() = default;
    MNEMorphMap(MNEMorphMap&&) = default;
    MNEMorphMap& operator=(MNEMorphMap&&) = default;
    ~MNEMorphMap() = default;
 
    //=========================================================================================================
    MNEMorphMap(const MNEMorphMap& other);
 
    //=========================================================================================================
    static MNEMorphMap compute(const Eigen::MatrixX3f& fromRr, const Eigen::MatrixX3i& fromTris, const Eigen::MatrixX3f& toRr);
 
    //=========================================================================================================
    static std::optional<MNEMorphMap> read(const QString& path, const QString& fromSubj, const QString& toSubj, int hemi);
 
    //=========================================================================================================
    static bool write(const QString& path, const QList<const MNEMorphMap*>& maps);
 
    //=========================================================================================================
    Eigen::SparseMatrix<double> toEigen() const;
 
public:
    std::unique_ptr<FIFFLIB::FiffSparseMatrix> map; 
    Eigen::VectorXi best;                           
    int hemi = -1;                                  
    QString from_subj;                              
    QString to_subj;                                
};
 
//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
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} // NAMESPACE MNELIB
 
#endif // MNEMORPHMAP_H