fs_atlas_lookup.h

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#ifndef FS_ATLAS_LOOKUP_H
#define FS_ATLAS_LOOKUP_H
 
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// INCLUDES
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#include "fs_global.h"
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
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#include <Eigen/Core>
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <QString>
#include <QStringList>
#include <QMap>
#include <QVector>
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE FSLIB
//=============================================================================================================
 
namespace FSLIB
{
 
//=============================================================================================================
class FSSHARED_EXPORT FsAtlasLookup
{
public:
    //=========================================================================================================
    FsAtlasLookup();
 
    //=========================================================================================================
    bool load(const QString& sParcellationPath);
 
    //=========================================================================================================
    QString labelAtRas(const Eigen::Vector3f& ras) const;
 
    //=========================================================================================================
    QStringList labelsForPositions(const QVector<Eigen::Vector3f>& positions) const;
 
    //=========================================================================================================
    bool isLoaded() const;
 
private:
    QVector<int> m_voxelData;           
    int m_dimX = 0;                     
    int m_dimY = 0;                     
    int m_dimZ = 0;                     
 
    Eigen::Matrix4f m_ras2vox;          
 
    QMap<int, QString> m_lookupTable;   
 
    bool m_loaded = false;
 
    //=========================================================================================================
    void initLookupTable();
 
    //=========================================================================================================
    Eigen::Vector3i rasToVoxel(const Eigen::Vector3f& ras) const;
};
 
} // namespace FSLIB
 
#endif // FS_ATLAS_LOOKUP_H