correlation.h

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#ifndef CORRELATION_H
#define CORRELATION_H
 
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// INCLUDES
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#include "../connectivity_global.h"
 
#include "abstractmetric.h"
#include "../connectivitysettings.h"
 
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// QT INCLUDES
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#include <QSharedPointer>
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
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#include <Eigen/Core>
 
//=============================================================================================================
// FORWARD DECLARATIONS
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//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE CONNECTIVITYLIB
//=============================================================================================================
 
namespace CONNECTIVITYLIB {
 
//=============================================================================================================
// CONNECTIVITYLIB FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
class Network;
 
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class CONNECTIVITYSHARED_EXPORT Correlation : public AbstractMetric
{
 
public:
    typedef QSharedPointer<Correlation> SPtr;            
    typedef QSharedPointer<const Correlation> ConstSPtr; 
    //=========================================================================================================
    explicit Correlation();
 
    //=========================================================================================================
    static Network calculate(ConnectivitySettings &connectivitySettings);
 
protected:
    //=========================================================================================================
    static Eigen::MatrixXd compute(const ConnectivitySettings::IntermediateTrialData& inputData);
 
    //=========================================================================================================
    static void reduce(Eigen::MatrixXd &resultData,
                       const Eigen::MatrixXd &data);
};
 
//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
} // namespace CONNECTIVITYLIB
 
#endif // CORRELATION_H