mne_meas_data.h

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#ifndef MNE_MEAS_DATA_H
#define MNE_MEAS_DATA_H
 
//=============================================================================================================
// INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include "mne_global.h"
#include <fiff/fiff_types.h>
 
#include "mne_types.h"
#include "mne_raw_data.h"
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <QSharedPointer>
 
//=============================================================================================================
// STL INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <memory>
#include <vector>
 
//=============================================================================================================
// FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
namespace FIFFLIB { class FiffCoordTrans; }
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE MNELIB
//=============================================================================================================
 
namespace MNELIB
{
 
//=============================================================================================================
// MNELIB FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
class MNEInverseOperator;
class MNEMeasDataSet;
class MNENamedMatrix;
 
//=============================================================================================================
class MNESHARED_EXPORT MNEMeasData
{
public:
    typedef QSharedPointer<MNEMeasData> SPtr;              
    typedef QSharedPointer<const MNEMeasData> ConstSPtr;   
 
    //=========================================================================================================
    MNEMeasData();
 
    //=========================================================================================================
    ~MNEMeasData();
 
    //=========================================================================================================
    void adjust_baselines(float bmin, float bmax);
 
    //============================= mne_read_data.c =============================

    static MNEMeasData* mne_read_meas_data_add(const QString&       name,
                                       int                  set,
                                       MNEInverseOperator*   op,
                                       MNENamedMatrix*       fwd,
                                       const QStringList&   namesp,
                                       int                  nnamesp,
                                       MNEMeasData*          add_to);

    static MNEMeasData* mne_read_meas_data(const QString&       name,
                                   int                  set,
                                   MNEInverseOperator*  op,
                                   MNENamedMatrix*      fwd,
                                   const QStringList&   namesp,
                                   int                  nnamesp);
 
public:
    QString                 filename;   
    FIFFLIB::FiffId          meas_id;    
    FIFFLIB::FiffTime       meas_date;  
    QList<FIFFLIB::FiffChInfo>     chs; 
    std::unique_ptr<FIFFLIB::FiffCoordTrans> meg_head_t; 
    std::unique_ptr<FIFFLIB::FiffCoordTrans> mri_head_t; 
    float                   sfreq;      
    int                     nchan;      
    float                   highpass;   
    float                   lowpass;    
    std::unique_ptr<MNEProjOp>  proj; 
    std::unique_ptr<MNECTFCompDataSet> comp; 
    MNEInverseOperator*     op;         
    MNENamedMatrix*         fwd; 
    std::unique_ptr<MNERawData> raw; 
    mneChSelection          chsel; 
    QStringList             badlist;    
    int                     nbad;       
    Eigen::VectorXi          bad;       
 
    bool                    ch_major;   
    QList<MNEMeasDataSet*>  sets;       
    int                     nset;       
    MNEMeasDataSet*         current;    
};
 
//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
} // NAMESPACE MNELIB
 
#endif // MNE_MEAS_DATA_H