annotationset.h

Go to the documentation of this file.

//=============================================================================================================
#ifndef ANNOTATION_SET_H
#define ANNOTATION_SET_H
 
//=============================================================================================================
// INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include "fs_global.h"
#include "annotation.h"
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <QString>
#include <QSharedPointer>
#include <QMap>
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE FSLIB
//=============================================================================================================
 
namespace FSLIB
{
 
//=============================================================================================================
// FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
class SurfaceSet;
 
//=============================================================================================================
class FSSHARED_EXPORT AnnotationSet
{
public:
    typedef QSharedPointer<AnnotationSet> SPtr;            
    typedef QSharedPointer<const AnnotationSet> ConstSPtr; 
    //=========================================================================================================
    AnnotationSet();
 
    //=========================================================================================================
    explicit AnnotationSet(const QString &subject_id, qint32 hemi, const QString &atlas, const QString &subjects_dir);
 
    //=========================================================================================================
    explicit AnnotationSet(const QString &path, qint32 hemi, const QString &atlas);
 
    //=========================================================================================================
    explicit AnnotationSet(const Annotation& p_LHAnnotation, const Annotation& p_RHAnnotation);
 
    //=========================================================================================================
    explicit AnnotationSet(const QString& p_sLHFileName, const QString& p_sRHFileName);
 
    //=========================================================================================================
    ~AnnotationSet(){}
 
    //=========================================================================================================
    void clear();
 
    //=========================================================================================================
    inline QMap<qint32, Annotation>& data();
 
    //=========================================================================================================
    inline bool isEmpty() const;
 
    //=========================================================================================================
    void insert(const Annotation& p_Annotation);
 
    //=========================================================================================================
    static bool read(const QString& p_sLHFileName, const QString& p_sRHFileName, AnnotationSet &p_AnnotationSet);
 
    //=========================================================================================================
    bool toLabels(const SurfaceSet &p_surfSet,
                  QList<Label> &p_qListLabels,
                  QList<Eigen::RowVector4i> &p_qListLabelRGBAs,
                  const QStringList& lLabelPicks = QStringList()) const;
 
    //=========================================================================================================
    Annotation& operator[] (qint32 idx);
 
    //=========================================================================================================
    const Annotation operator[] (qint32 idx) const;
 
    //=========================================================================================================
    Annotation& operator[] (QString idt);
 
    //=========================================================================================================
    const Annotation operator[] (QString idt) const;
 
    //=========================================================================================================
    inline qint32 size() const;
 
private:
    QMap<qint32, Annotation> m_qMapAnnots;   
};
 
//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
 
inline QMap<qint32, Annotation>& AnnotationSet::data()
{
    return m_qMapAnnots;
}
 
//=============================================================================================================
 
inline bool AnnotationSet::isEmpty() const
{
    return m_qMapAnnots.isEmpty();
}
 
//=============================================================================================================
 
inline qint32 AnnotationSet::size() const
{
    return m_qMapAnnots.size();
}
} // NAMESPACE
 
#endif // ANNOTATION_SET_H