surfaceset.cpp

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// INCLUDES
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#include "surfaceset.h"
 
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// QT INCLUDES
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#include <QStringList>
 
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// USED NAMESPACES
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using namespace FSLIB;
using namespace Eigen;
 
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// DEFINE MEMBER METHODS
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SurfaceSet::SurfaceSet()
{
}
 
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SurfaceSet::SurfaceSet(const QString &subject_id, qint32 hemi, const QString &surf, const QString &subjects_dir)
{
    Surface t_Surface;
    if(hemi == 0 || hemi == 1)
    {
        if(Surface::read(subject_id, hemi, surf, subjects_dir, t_Surface))
            insert(t_Surface);
    }
    else if(hemi == 2)
    {
        if(Surface::read(subject_id, 0, surf, subjects_dir, t_Surface))
            insert(t_Surface);
        if(Surface::read(subject_id, 1, surf, subjects_dir, t_Surface))
            insert(t_Surface);
    }
 
    calcOffset();
}
 
//=============================================================================================================
 
SurfaceSet::SurfaceSet(const QString &path, qint32 hemi, const QString &surf)
{
    Surface t_Surface;
    if(hemi == 0 || hemi == 1)
    {
        if(Surface::read(path, hemi, surf, t_Surface))
            insert(t_Surface);
    }
    else if(hemi == 2)
    {
        if(Surface::read(path, 0, surf, t_Surface))
            insert(t_Surface);
        if(Surface::read(path, 1, surf, t_Surface))
            insert(t_Surface);
    }
 
    calcOffset();
}
 
//=============================================================================================================
 
SurfaceSet::SurfaceSet(const Surface& p_LHSurface, const Surface& p_RHSurface)
{
    if(p_LHSurface.hemi() == 0)
        m_qMapSurfs.insert(0, p_LHSurface);
    else
        qWarning("Left hemisphere id is not 0. LH surface not assigned!");
 
    if(p_RHSurface.hemi() == 1)
        m_qMapSurfs.insert(1, p_RHSurface);
    else
        qWarning("Right hemisphere id is not 1. RH surface not assigned!");
 
    calcOffset();
}
 
//=============================================================================================================
 
SurfaceSet::SurfaceSet(const QString& p_sLHFileName, const QString& p_sRHFileName)
{
    SurfaceSet t_SurfaceSet;
    if(SurfaceSet::read(p_sLHFileName, p_sRHFileName, t_SurfaceSet))
        *this = t_SurfaceSet;
}
 
//=============================================================================================================
 
SurfaceSet::~SurfaceSet()
{
}
 
//=============================================================================================================
 
void SurfaceSet::clear()
{
    m_qMapSurfs.clear();
}
 
//=============================================================================================================
 
void SurfaceSet::insert(const Surface& p_Surface)
{
    if(p_Surface.isEmpty())
        return;
 
    qint32 hemi = p_Surface.hemi();
    m_qMapSurfs.remove(hemi);
 
    m_qMapSurfs.insert(hemi, p_Surface);
}
 
//=============================================================================================================
 
bool SurfaceSet::read(const QString& p_sLHFileName, const QString& p_sRHFileName, SurfaceSet &p_SurfaceSet)
{
    p_SurfaceSet.clear();
 
    QStringList t_qListFileName;
    t_qListFileName << p_sLHFileName << p_sRHFileName;
 
    for(qint32 i = 0; i < t_qListFileName.size(); ++i)
    {
        Surface t_Surface;
        if(Surface::read(t_qListFileName[i], t_Surface))
        {
            if(t_qListFileName[i].contains("lh."))
                p_SurfaceSet.m_qMapSurfs.insert(0, t_Surface);
            else if(t_qListFileName[i].contains("rh."))
                p_SurfaceSet.m_qMapSurfs.insert(1, t_Surface);
            else
                return false;
        }
    }
 
    p_SurfaceSet.calcOffset();
 
    return true;
}
 
//=============================================================================================================
 
const Surface& SurfaceSet::operator[] (qint32 idx) const
{
    if(idx == 0)
        return m_qMapSurfs.find(idx).value();
    else if(idx == 1)
        return m_qMapSurfs.find(idx).value();
    else
    {
        qWarning("Warning: Index is not '0' or '1'! Returning '0'.");
        return m_qMapSurfs.find(0).value();
    }
}
 
//=============================================================================================================
 
Surface& SurfaceSet::operator[] (qint32 idx)
{
    if(idx == 0)
        return m_qMapSurfs.find(idx).value();
    else if(idx == 1)
        return m_qMapSurfs.find(idx).value();
    else
    {
        qWarning("Warning: Index is not '0' or '1'! Returning '0'.");
        return m_qMapSurfs.find(0).value();
    }
}
 
//=============================================================================================================
 
const Surface& SurfaceSet::operator[] (QString idt) const
{
    if(idt.compare("lh") == 0)
        return m_qMapSurfs.find(0).value();
    else if(idt.compare("rh") == 0)
        return m_qMapSurfs.find(1).value();
    else
    {
        qWarning("Warning: Identifier is not 'lh' or 'rh'! Returning 'lh'.");
        return m_qMapSurfs.find(0).value();
    }
}
 
//=============================================================================================================
 
Surface& SurfaceSet::operator[] (QString idt)
{
    if(idt.compare("lh") == 0)
        return m_qMapSurfs.find(0).value();
    else if(idt.compare("rh") == 0)
        return m_qMapSurfs.find(1).value();
    else
    {
        qWarning("Warning: Identifier is not 'lh' or 'rh'! Returning 'lh'.");
        return m_qMapSurfs.find(0).value();
    }
}
 
//=============================================================================================================
 
void SurfaceSet::calcOffset()
{
    //
    // Correct inflated offset
    //
    if(m_qMapSurfs.size() == 2 && QString::compare(m_qMapSurfs.begin().value().surf(),"inflated") == 0)
    {
        float xOffset = m_qMapSurfs.find(0).value().rr().col(0).maxCoeff() - m_qMapSurfs.find(1).value().rr().col(0).minCoeff();
        Vector3f vecLhOffset, vecRhOffset;
        vecLhOffset << (xOffset/2.0f), 0, 0;
        vecRhOffset << (-xOffset/2.0f), 0, 0;
        m_qMapSurfs.find(0).value().offset() = vecLhOffset;
        m_qMapSurfs.find(1).value().offset() = vecRhOffset;
    }
}