MNE-CPP  0.1.9
A Framework for Electrophysiology
pwlrapmusic.h
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1 //=============================================================================================================
36 #ifndef PWLRAPMUSIC_H
37 #define PWLRAPMUSIC_H
38 
39 //=============================================================================================================
40 // INCLUDES
41 //=============================================================================================================
42 
43 #include "../inverse_global.h"
44 #include "rapmusic.h"
45 
46 #include "dipole.h"
47 
48 #include <mne/mne_forwardsolution.h>
49 #include <mne/mne_sourceestimate.h>
50 #include <time.h>
51 
52 #include <QVector>
53 
54 //=============================================================================================================
55 // EIGEN INCLUDES
56 //=============================================================================================================
57 
58 #include <Eigen/Core>
59 #include <Eigen/SVD>
60 #include <Eigen/LU>
61 
62 //=============================================================================================================
63 // DEFINE NAMESPACE INVERSELIB
64 //=============================================================================================================
65 
66 namespace INVERSELIB
67 {
68 
69 //=============================================================================================================
70 // SOME DEFINES
71 //=============================================================================================================
72 
73 #define NOT_TRANSPOSED 0
74 #define IS_TRANSPOSED 1
76 //=============================================================================================================
77 
82 class INVERSESHARED_EXPORT PwlRapMusic : public RapMusic
83 {
84 public:
85 
86  //=========================================================================================================
90  PwlRapMusic();
91 
92  //=========================================================================================================
102  PwlRapMusic(MNELIB::MNEForwardSolution& p_pFwd, bool p_bSparsed, int p_iN = 2, double p_dThr = 0.5);
103 
104  virtual ~PwlRapMusic();
105 
106  //=========================================================================================================
117  virtual MNELIB::MNESourceEstimate calculateInverse(const FIFFLIB::FiffEvoked &p_fiffEvoked, bool pick_normal = false);
118 
119  //=========================================================================================================
131  virtual MNELIB::MNESourceEstimate calculateInverse(const Eigen::MatrixXd &data, float tmin, float tstep) const;
132 
133  virtual MNELIB::MNESourceEstimate calculateInverse(const Eigen::MatrixXd& p_matMeasurement, QList< DipolePair<double> > &p_RapDipoles) const;
134 
135  static int PowellOffset(int p_iRow, int p_iNumPoints);
136 
137  static void PowellIdxVec(int p_iRow, int p_iNumPoints, Eigen::VectorXi& p_pVecElements);
138 
139  virtual const char* getName() const;
140 };
141 
142 //=============================================================================================================
143 // INLINE DEFINITIONS
144 //=============================================================================================================
145 } //NAMESPACE
146 
147 #endif // PWLRAPMUSIC_H
INVERSELIB::PwlRapMusic
The PwlRapMusic class provides the POWELL RAP MUSIC Algorithm CPU implementation. ToDo: Paper referen...
Definition: pwlrapmusic.h:82
INVERSESHARED_EXPORT
#define INVERSESHARED_EXPORT
Definition: inverse_global.h:56
rapmusic.h
RapMusic algorithm class declaration.
INVERSELIB::DipolePair
Definition: dipole.h:56
MNELIB::MNEForwardSolution
Forward operator.
Definition: mne_forwardsolution.h:170
MNELIB::MNESourceEstimate
Source estimation.
Definition: mne_sourceestimate.h:84
mne_forwardsolution.h
MNEForwardSolution class declaration, which provides the forward solution including the source space ...
INVERSELIB::RapMusic
The RapMusic class provides the RAP MUSIC Algorithm CPU implementation. ToDo: Paper references.
Definition: rapmusic.h:92
FIFFLIB::FiffEvoked
evoked data
Definition: fiff_evoked.h:77
dipole.h
ToDo Documentation...
mne_sourceestimate.h
MNESourceEstimate class declaration.
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