mne_bem_surface.h

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#ifndef MNE_BEM_SURFACE_H
#define MNE_BEM_SURFACE_H

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// INCLUDES
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#include "mne_global.h"

#include <fiff/fiff_types.h>
#include <fiff/fiff.h>

//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================

#include <Eigen/Core>
#include <Eigen/SparseCore>

//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
//=============================================================================================================

#include <QList>

//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE MNELIB
//=============================================================================================================

namespace MNELIB
{

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// FORWARD DECLARATIONS
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//=============================================================================================================
class MNESHARED_EXPORT MNEBemSurface
{
public:
    typedef QSharedPointer<MNEBemSurface> SPtr;             
    typedef QSharedPointer<const MNEBemSurface> ConstSPtr;  
    //=========================================================================================================
    MNEBemSurface();

    //=========================================================================================================
    MNEBemSurface(const MNEBemSurface& p_MNEBemSurface);

    //=========================================================================================================
    ~MNEBemSurface();

    //=========================================================================================================
    void clear();

    //=========================================================================================================
    bool addTriangleData();

    //=========================================================================================================
    bool add_geometry_info();

    //=========================================================================================================
    bool addVertexNormals();

    //=========================================================================================================
    void writeToStream(FIFFLIB::FiffStream* p_pStream);

    //=========================================================================================================
    static QString id_name(int id);

public:
    FIFFLIB::fiff_int_t id;            
    FIFFLIB::fiff_int_t np;            
    FIFFLIB::fiff_int_t ntri;          
    FIFFLIB::fiff_int_t coord_frame;   
    FIFFLIB::fiff_float_t sigma;       
    Eigen::MatrixX3f rr;               
    Eigen::MatrixX3f nn;               
    Eigen::MatrixX3i tris;             
    Eigen::MatrixX3d tri_cent;         
    Eigen::MatrixX3d tri_nn;           
    Eigen::VectorXd tri_area;          
    QVector<QVector<int> > neighbor_tri;           
    QVector<QVector<int> > neighbor_vert;          
};

//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
} // NAMESPACE

#endif // MNE_BEMSURFACE_H