correlation.h

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#ifndef CORRELATION_H
#define CORRELATION_H

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// INCLUDES
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#include "../connectivity_global.h"

#include "abstractmetric.h"
#include "../connectivitysettings.h"

//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
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#include <QSharedPointer>

//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
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#include <Eigen/Core>

//=============================================================================================================
// FORWARD DECLARATIONS
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//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE CONNECTIVITYLIB
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namespace CONNECTIVITYLIB {

//=============================================================================================================
// CONNECTIVITYLIB FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================

class Network;

//=============================================================================================================
class CONNECTIVITYSHARED_EXPORT Correlation : public AbstractMetric
{    

public:
    typedef QSharedPointer<Correlation> SPtr;            
    typedef QSharedPointer<const Correlation> ConstSPtr; 
    //=========================================================================================================
    explicit Correlation();

    //=========================================================================================================
    static Network calculate(ConnectivitySettings &connectivitySettings);

protected:
    //=========================================================================================================
    static Eigen::MatrixXd compute(const ConnectivitySettings::IntermediateTrialData& inputData);

    //=========================================================================================================
    static void reduce(Eigen::MatrixXd &resultData,
                       const Eigen::MatrixXd &data);
};

//=============================================================================================================
// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
} // namespace CONNECTIVITYLIB

#endif // CORRELATION_H