geometryinfo.h

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#ifndef DISP3DLIB_GEOMETRYINFO_H
#define DISP3DLIB_GEOMETRYINFO_H
 
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// INCLUDES
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#include "../../disp3D_global.h"
#include <fiff/fiff_evoked.h>
 
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// INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <limits>
 
//=============================================================================================================
// QT INCLUDES
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#include <QSharedPointer>
#include <QVector>
 
//=============================================================================================================
// EIGEN INCLUDES
//=============================================================================================================
 
#include <Eigen/Core>
 
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// FORWARD DECLARATIONS
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namespace MNELIB {
    class MNEmatVertices;
}
 
//=============================================================================================================
// DEFINE NAMESPACE DISP3DLIB
//=============================================================================================================
 
namespace DISP3DLIB {
 
#define FLOAT_INFINITY std::numeric_limits<float>::infinity()
 
//=============================================================================================================
// DISP3DLIB FORWARD DECLARATIONS
//=============================================================================================================
 
//=============================================================================================================
class DISP3DSHARED_EXPORT GeometryInfo
{
 
public:
    typedef QSharedPointer<GeometryInfo> SPtr;            
    typedef QSharedPointer<const GeometryInfo> ConstSPtr; 
    //=========================================================================================================
    GeometryInfo() = delete;
 
    //=========================================================================================================
    static QSharedPointer<Eigen::MatrixXd> scdc(const Eigen::MatrixX3f &matVertices,
                                                const QVector<QVector<int> > &vecNeighborVertices,
                                                QVector<int> &pVecVertSubset,
                                                double dCancelDist = FLOAT_INFINITY);
 
    //=========================================================================================================
    static QVector<int> projectSensors(const Eigen::MatrixX3f &matVertices,
                                       const QVector<Eigen::Vector3f> &vecSensorPositions);
 
    //=========================================================================================================
    static QVector<int> filterBadChannels(QSharedPointer<Eigen::MatrixXd> matDistanceTable,
                                          const FIFFLIB::FiffInfo& fiffInfo,
                                          qint32 iSensorType);
 
protected:
    //=========================================================================================================
    static inline  double squared(double dBase);
 
    //=========================================================================================================
    static QVector<int> nearestNeighbor(const Eigen::MatrixX3f &matVertices,
                                        QVector<Eigen::Vector3f>::const_iterator itSensorBegin,
                                        QVector<Eigen::Vector3f>::const_iterator itSensorEnd);
 
    //=========================================================================================================
    static void iterativeDijkstra(QSharedPointer<Eigen::MatrixXd> matOutputDistMatrix,
                                  const Eigen::MatrixX3f &matVertices,
                                  const QVector<QVector<int> > &vecNeighborVertices,
                                  const QVector<int> &vecVertSubset,
                                  qint32 iBegin,
                                  qint32 iEnd,
                                  double dCancelDistance);
};
 
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// INLINE DEFINITIONS
//=============================================================================================================
 
inline double GeometryInfo::squared(double dBase)
{
    return dBase * dBase;
}
} // namespace GEOMETRYINFO
 
#endif // DISP3DLIB_GEOMETRYINFO_H